Análisis preliminar de la estructura primaria y secundaria del ARNtTrp en tortugas marinas

Harvey Infante-Rojas; Javier Hernández-Fernández

doi:10.21789/22561498.1016

Enviado: 2015-08-05

Publicado: 2015-08-05

DOI: 10.21789/22561498.1016

Análisis preliminar de la estructura primaria y secundaria del ARNtTrp en tortugas marinas

Harvey Infante-Rojas

Universidad Jorge Tadeo Lozano, Laboratorio de Genética, Biología Molecular y Bioinformática

javier.hernandez@utadeo.edu.co

https://orcid.org/0000-0002-9516-1450

Javier Hernández-Fernández

Universidad Jorge Tadeo Lozano, Laboratorio de Genética, Biología Molecular y Bioinformática

javier.hernandez@utadeo.edu.co

https://orcid.org/0000-0001-8442-9266

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Número: Vol. 5 Núm. 1 (2015)

Cómo citar

Infante-Rojas, H., & Hernández-Fernández, J. (2015). Análisis preliminar de la estructura primaria y secundaria del ARNtTrp en tortugas marinas. Revista Mutis, 5(1), 28–36. https://doi.org/10.21789/22561498.1016

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Resumen

Actualmente existen siete especies de tortugas marinas, todas amenazadas o en riesgo inminente de extinción. Los estudios con ADN mitocondrial han permitido hacer acercamientos sobre filogenia, evolución, rutas migratorias y centros de dispersión, además para la identificación de polimorfismos y haplotipos, siendo base para planes de manejo y conservación. El presente estudio representa la primera descripción comparada de la estructura primaria y secundaria del ARNtTrp mitocondrial en tortugas marinas. Se realizó un alineamiento múltiple de 26 secuencias del gen que codifica para el ARNtTrp y se propuso la estructura secundaria utilizando el programa ARWEN. Se identificaron potenciales interacciones terciarias por homología comparada con el ARNtTrp de mamíferos. Los resultados mostraron una secuencia consenso de 76 bases con siete regiones conservadas que representan el 76 % de la molécula. Se identificaron polimorfismos que representan tres haplotipos para C. caretta, dos para C. mydas y uno para cada una de las demás especies. Las estructuras secundarias mostraron cambios nucleotídicos puntuales para cada especie y también mostraron que el tallo aceptor, el brazo TψC y el bucle anticodón son motivos conservados en el ARNtTrp de las tortugas marinas. Se encontró un enlace no canónico tipo A-A en el tallo DHU que podría considerarse característico de tortugas marinas. Además, se obtuvo una estructura secundaria consenso en donde se identificaron las siete regiones conservadas, seis posibles interacciones terciarias y el bucle DHU como región variable.

Palabras clave

ARNtTrp