ARDRA para la identificación de las bacterias coliformes Citrobacter sedlakii y Citrobacter gilleni, del humedal “Laguna de Tierra Blanca” Soacha, Cundinamarca

Javier Hernández Fernández; Laura Becerra; Viviana Puentes; Julio Martínez

doi:10.21789/22561498.360

Enviado: 2012-06-28

Publicado: 2012-06-28

DOI: 10.21789/22561498.360

ARDRA para la identificación de las bacterias coliformes Citrobacter sedlakii y Citrobacter gilleni, del humedal “Laguna de Tierra Blanca” Soacha, Cundinamarca

Javier Hernández Fernández

Universidad Jorge Tadeo Lozano

javier.hernandez@utadeo.edu.co

https://orcid.org/0000-0001-8442-9266

Laura Becerra

Universidad Jorge Tadeo Lozano

laura_milena1990@hotmail.com

https://orcid.org/0000-0003-3565-2343

Viviana Puentes

Universidad Jorge Tadeo Lozano

vivipuma_157@hotmail.com

https://orcid.org/0000-0002-8900-853X

Julio Martínez

Universidad Jorge Tadeo Lozano

julcemo13@gmail.com

https://orcid.org/0000-0002-7552-6803

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Número: Vol. 2 Núm. 2 (2012)

Cómo citar

Hernández Fernández, J., Becerra, L., Puentes, V., & Martínez, J. (2012). ARDRA para la identificación de las bacterias coliformes Citrobacter sedlakii y Citrobacter gilleni, del humedal “Laguna de Tierra Blanca” Soacha, Cundinamarca. Revista Mutis, 2(2), 76–88. https://doi.org/10.21789/22561498.360

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Resumen

Muestras de agua del humedal “Laguna de tierra blanca” de Soacha, Cundinamarca, fueron sembradas en agar MacConkey y EMB. Una colonia verde metálico, catalasa positiva y oxidasa negativa se resembró de nuevo en agar EMB y fue sometida a la prueba bioquímica API E20. Se extrajo el DNA, se amplificó el gen 16S rRNA por PCR y se cortó con las endonucleasas de restricción AluI y HpyCH4III. Un análisis de ARDRA in silico fue realizado para 11 secuencias del gen 16S rRNA de todas las especies del género, reportadas en GenBank. El sistema API E20 reveló la presencia de Citrobacter sp. El análisis de ARDRA mostró que el patrón de bandas generado por HpyCH4III no presentó ninguna coincidencia con los reportados en GenBank. AluI presentó seis bandas con tamaños de 592, 338, 368, 227, 95, 92 y 49 pb, coincidiendo con las bandas in silico reportadas para las especies Citrobacter sedlakii y Citrobacter gillenii, presentándose para cada especie bacteriana una banda adicional. La banda de 367 pb identificó a C. gillenii y la de 338 pb a.C. sedlakii, concluyéndose que la colonia aislada contenía posiblemente estas dos cepas bacterianas.